佟铁铸,刘星,李春萍,周宇,丁宁,罗卓军,朱事康.广东地区猪戊型肝炎流行病学调查.中国动物传染病学报,,25(4):13-18.该研究由国家质量监督检验检疫总局科技计划项目
摘要:为了调查广东地区猪戊型肝炎感染和流行情况,本研究对~年广东地区猪场抽取的血样进行抗体检测,对猪肝和粪便样品进行病毒核酸检测,PCR结果阳性的样品进行序列分析,确定所感染戊型肝炎病毒的基因型。结果显示,戊型肝炎病毒抗体平均阳性率为69.2%,PCR阳性率为46.7%,对PCR结果阳性的30株样品基因序列分析显示,29株为基因型Ⅳ型,1株为基因型Ⅲ型。
戊型肝炎(hepatitisE,HE)是由戊型肝炎病毒(HepatitisEvirus,HEV)引发的一种急性病毒性肝炎,主要通过消化道感染传播。HE是一种人畜共患传染病,猪作为主要的动物宿主,成为HEV的巨大病毒储存库,为HE的感染、传播,以及变异进化提供了充分的遗传信息资源。HE无论对养殖业还是人类的健康与生命安全都造成极大的威胁。目前,HE已被世界卫生组织(WHO)认定是发展中国家的一个重要公共卫生问题。HEV只有一种血清型,但是基因型有几种,目前认为其主要有4个基因型(基因1~4型)。其中基因3型和基因4型可以同时感染人和猪,具有人畜共患的属性,而且基因4型HEV对人的致病性较其他基因型更强,危害也更大。本研究于~年对广东地区猪场采取血样、粪便、猪肝样品,进行戊型肝炎流行病学以及基因型分析。
1样品来源~年采自广东省各地区的10个猪场的份血清样品、份猪粪便及猪肝样品,编号后冷冻送回实验室。用PBS将份猪粪便、猪肝样品制备成10%的悬浮液,于4℃、×g离心15min,收集上清液,于-70℃保存备用。
2引物设计与合成从GenBank中提取基因3、4型HEV全基因序列12个(见表1),利用ClustalX软件进行序列分析比对后,于ORF2近5端的共同保守区~nt片段设计一套兼并引物,其理论扩增片段大小为bp。
外引物:EXF:5-AAYTCTTACACTAATACACCTTA-3;
EXR:5-GAGTAGAACAGCTGACC-3;
内引物:INF:5-CTTGATTTTGCGCTAGAGCT-3;
INR:5-CCAGCCGACGAAATRAATTC-3;
其中,R=A/G;Y=C/T。
表1用于引物设计的HEV参考毒株
Table1HEVreferencestrainsusedforprimerdesign
3引物的同源性和特异性分析外引物EXF5端第9、12碱基是基因3型和基因4型的主要变异位点,EXR引物5端6、9碱基也是高变位点。内引物INF、INR在基因Ⅲ、Ⅳ型序列中保守,能够与12条基因Ⅲ、Ⅳ序列很好配对。因此,该兼并引物可以适用于检测基因Ⅲ、Ⅳ型HEV序列。同时,为了检验引物的特异性,将这4条引物与GenBank数据库进行BLAST分析,并未发现能配对非HEV序列,表明此引物的特异性较好。
图1引物与12条HEV全基因序列的同源比较
Fig.1Thehomologous